К важнейшим заслугам С.Г. Раутиана следует отнести создание школы физиков-лазерщиков в Сибири.
Здесь он начал работать с 1965 года, когда лазерная физика находилась на самых первых этапах своего становления. Научный "задел", наработанный им в ФИАНе, послужил мощным толчком для быстрого наращивания квалификации молодых специалистов, решивших посвятить себя новой, перспективной области науки.
Особое внимание С.Г. Раутиан всегда уделял обучению студентов и формированию из них специалистов-профессионалов. Его педагогическая деятельность была связана с Московским "физтехом" и (в особенности) с Новосибирским государственным университетом. В 1965 г. им была организована в НГУ специальность «Оптика», которая впоследствии была преобразована в кафедру «Квантовая оптика», и С.Г. Раутиан являлся ее бессменным руководителем вплоть до 2002 года.
Для студентов им читались спецкурсы «Оптические квантовые генераторы", "Нелинейная оптика" , "Физическая оптика".
3а время существования кафедра подготовила более 400 дипломников, из них более 80 стали кандидатами наук и 17 - докторами наук. Выпускники кафедры работают не только в Новосибирском научном центре, но и в других научных центрах Сибири, а также в других регионах страны и за рубежом. Подавляющее большинство из них получили признание как специалисты высокого класса. В период 1976-1982 гг. С.Г. Раутиан был деканом физического факультета НГУ.
Под непосредственным руководством С.Г. Раутиана защищены 27 кандидатских диссертаций, 15 из его учеников стали докторами наук, один - членом-корреспондентом РАН. Это то, что подпадает под формальные критерии. По существу же есть еще целый ряд кандидатов и докторов наук, которые с гордостью причисляют себя к выходцам из школы С.Г. Раутиана: это и ученики учеников, и те, которые, уже будучи «остепененными», существенно пополнили свой научный багаж в результате плодотворного общения с ним.
С. Г. Раутиан принимал активное участие в общественной жизни Университета. Ему принадлежала, в частности, инициатива проведения лыжных соревнований между студентами и преподавателями ФФ.
С 1977 – 1982 гг. работал межинститутский семинар "Проблемы современной оптики и спектроскопии", организованный и проводимый С. Г. Раутианом в НГУ.